Biologia molekularna:
- badania nad molekularnymi mechanizmami chorób uwarunkowanych genetycznie,
w szczególności nad mechanizmami regulującymi ekspresję genów, włączając mechanizmy epigenetyczne (metylacja genomowego DNA) - ocena zmian genetycznych, epigenetycznych oraz zmian ekspresji białek w nowotworach regionu głowy i szyi oraz w niedrobnokomórkowym raku płuca
- poszukiwanie nowych biomarkerów wielu chorób, zwłaszcza cywilizacyjnych
Stosowane metody:
- izolacja DNA, RNA, miRNA z różnych typów tkanek
- amplifikacja wybranych fragmentów DNA z oceną ich wielkości metodą elektroforezy agarozowej
- rozdział RNA metodą elektroforezy kapilarnej.
- ocena poziomu ekspresji genów techniką ilościowej PCR w czasie rzeczywistym (RT-qPCR)
- określanie polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP)
- analiza sekwencji wybranych fragmentów DNA – sekwencjonowanie metodą Sangera
- oznaczanie ekspresji białek w homogenatach tkankowych i w surowicy
- projektowanie i operowanie plazmidami (transfekcja)
- hodowla ludzkich komórek nowotworowych, fibroblastów skóry oraz bakterii
Bioinformatyka:
- analiza wyników dotyczących ekspresji genów oraz miRNA w oparciu o dostępne dane literaturowe oraz elektroniczne bazy danych
- data-mining
- analiza SNP
- obróbka i analiza danych z sekwencjonowania (metoda Sangera, NGS)
- analiza danych mikromacierzowych
- analiza obrazów z mikroskopii fluorescencyjnej oraz testów kometowych
- analiza wyników PCR, RT-qPCR oraz elektroforezy (DNA, RNA, SDS-PAGE, western blot)
- analiza ścieżek sygnałowych oraz ontologii genowych
- analiza statystyczna danych biologicznych (parametry biochemiczne, dane populacyjne, ekspresja genów, globalna metylacja) w oparciu o oprogramowanie: STATISTICA, MATLAB
Diagnostyka laboratoryjna:
- ocena udziału hormonów i polipeptydowych czynników wzrostu w patogenezie różnych stanów chorobowych
- oznaczanie stężenia różnych analitów w materiale biologicznym (neuropeptydy, neurotransmitery, hormony i ich metabolity, czynniki wzrostu, cytokiny)
Stosowane metody:
- immunochemia (testy ELISA)
- nefelometria
- ocena stężenia białka całkowitego w surowicy krwi oraz homogenatach tkanek
Parazytologia i Akaroentomologia medyczna:
- badania nad akarofauną stawonogów pasożytniczych
- badania nad rolą pasożytniczych stawonogów w przenoszeniu oraz krążeniu w środowisku czynników etiologicznych chorób transmisyjnych ze szczególnym uwzględnieniem medycznego i epidemiologicznego znaczenia kleszczy
- badania nad rolą zwierząt (domowych i dzikich) w krążeniu w środowisku czynników etiologicznych chorób transmisyjnych
- ocena potencjalnego narażenia ludzi i zwierząt na kontakt z pasożytniczymi stawonogami oraz przenoszonymi przez nie patogenami
- badania nad epidemiologią chorób transmisyjnych
Stosowane metody:
- izolacja DNA, RNA ze stawonogów oraz różnych typów tkanek
- amplifikacja wybranych specyficznych fragmentów DNA metodą PCR, nested PCR, PCR-RFLP oraz ocena wielkości otrzymanych produktów reakcji metodą elektroforezy agarozowej
- detekcja czynników etiologicznych chorób transmisyjnych w populacji wektora techniką PCR w czasie rzeczywistym (real time PCR)
- analiza sekwencji wybranych fragmentów DNA – sekwencjonowanie metodą Sangera
- analizy metodami immunochemicznymi (testy ELISA)
- analizy białek metodą western blot